نشأت فكرة إنشاء الكنيسة حين اجتمعت جماعة من موظفي حي شيكولاني بشبرا حول رغبة في مكان للاجتماعات الدينية، فبدأوا بغرفتين بسيطتين باسم "الجمعية القبطية الأرثوذكسية"، معتمدين فقط على نعمة الله واشتراك شهري متواضع من أعضائها.

في مارس ١٩٣٥ تمكنت الجمعية من شراء قطعة أرض أمام مستشفى كتشنر، وبمشاركة القمص بطرس عطا الله الجوهري الذي دعا كل عائلة في الحي للتبرع الشهري، بدأ العمل الفعلي. وبمعجزة واضحة، وُجدت كل مواد البناء اللازمة أمام الموقع في صباح يوم واحد دون أن يعرف أحد من أحضرها.

اكتمل البناء المؤقت للكنيسة خلال أيام قليلة، وفي "أحد الشعانين" ٢١ إبريل ١٩٣٥ افتتح نيافة الأنبا إبرام مطران الجيزة الكنيسة وصلى أول قداس بحضور آلاف المصلين. واختير لها اسم القديس العظيم الأنبا أنطونيوس، أب الرهبنة، بتوجيه من الأنبا كيرلس مطران قنا والأنبا ثاؤفيلس مطران قوص، تمييزاً لها كثالث كنيسة في حي شبرا.

صدر الأمر الملكي رقم ٦٤ لسنة ١٩٣٨ من الملك فاروق بالترخيص بإنشاء الكنيسة الدائمة، وتم بناؤها بإشراف المهندس باسيلي سوريال، حتى أُقيم حفل رفع الصليب في ٨ ديسمبر ١٩٥٠ في عهد البابا يوساب الثاني، لتكتمل بذلك رحلة بيت قامه شعب بسيط بإيمان كبير.

محطات في تاريخ الكنيسة